⚠ 人口が少ない自治体では秘匿処理（非公表）になる場合があります。賃貸・売却・二次利用可能な物件数を示す「その他空き家」とは異なり、全空き家を計上します。
| 熊本県内順位 | 自治体 | 空き家率（%） |
|---|---|---|
| 1位 全国19位 | 菊陽町 | 6.70% |
| 2位 全国41位 | 益城町 | 7.30% |
| 3位 全国48位 | 合志市 | 7.60% |
| 4位 全国62位 | 大津町 | 8.00% |
| 5位 全国210位 | 御船町 | 10.60% |
| 6位 全国421位 | 熊本市 | 13.20% |
| 7位 全国453位 | 菊池市 | 13.50% |
| 7位 全国453位 | 宇土市 | 13.50% |
| 9位 全国502位 | 宇城市 | 14.00% |
| 10位 全国545位 | 長洲町 | 14.50% |
| 11位 全国649位 | 八代市 | 16.20% |
| 12位 全国711位 | 玉名市 | 17.20% |
| 13位 全国733位 | 荒尾市 | 17.80% |
| 14位 全国739位 | 芦北町 | 17.90% |
| 15位 全国788位 | 人吉市 | 18.70% |
| 16位 全国800位 | 阿蘇市 | 18.90% |
| 17位 全国825位 | 山鹿市 | 19.40% |
| 18位 全国963位 | 天草市 | 24.40% |
| 19位 全国978位 | 水俣市 | 25.30% |
| 20位 全国992位 | 上天草市 | 26.40% |
2023年（令和5年）住宅・土地統計調査 出典: 令和5年住宅・土地統計調査 算出方法